MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 9626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002944	GCCGG	2	10	3013451	3013460	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6002	NC_002944	CCAGTC	2	12	3013498	3013509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_002944	GGTG	2	8	3013561	3013568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_002944	CGC	2	6	3013582	3013587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_002944	GCC	2	6	3013597	3013602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_002944	CGA	2	6	3013611	3013616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_002944	CGC	2	6	3013632	3013637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_002944	CCG	2	6	3013638	3013643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_002944	CGC	2	6	3013651	3013656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_002944	CCG	2	6	3013662	3013667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_002944	CGT	2	6	3013678	3013683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_002944	GTC	2	6	3013735	3013740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_002944	CTC	2	6	3014159	3014164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_002944	CAA	2	6	3015067	3015072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_002944	CCGA	2	8	3015519	3015526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_002944	GCC	2	6	3015542	3015547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_002944	GCC	2	6	3015552	3015557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_002944	CT	3	6	3015570	3015575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_002944	GGA	2	6	3015604	3015609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_002944	CT	3	6	3015618	3015623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_002944	GCC	2	6	3015642	3015647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_002944	CGT	2	6	3015661	3015666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_002944	CGT	2	6	3015677	3015682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_002944	CAT	2	6	3015706	3015711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_002944	ATG	2	6	3015723	3015728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_002944	ACG	2	6	3015755	3015760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_002944	GCA	2	6	3015846	3015851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_002944	GCT	2	6	3016911	3016916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_002944	TCG	2	6	3016925	3016930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_002944	CGG	3	9	3016985	3016993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_002944	CGAC	2	8	3018105	3018112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_002944	GCGCC	2	10	3018128	3018137	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6033	NC_002944	CGG	2	6	3020481	3020486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_002944	GCC	2	6	3020498	3020503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_002944	CCT	2	6	3025317	3025322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_002944	GAA	2	6	3025324	3025329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_002944	CG	3	6	3025366	3025371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_002944	GCG	2	6	3032944	3032949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_002944	GCC	2	6	3032952	3032957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_002944	CGAG	2	8	3033007	3033014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_002944	CTC	2	6	3034343	3034348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_002944	CG	3	6	3034363	3034368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_002944	GCA	2	6	3034397	3034402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_002944	GCC	2	6	3034444	3034449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_002944	GCA	2	6	3034453	3034458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_002944	ACG	2	6	3034482	3034487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_002944	GCA	2	6	3034507	3034512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_002944	GC	3	6	3034519	3034524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_002944	GC	3	6	3034533	3034538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_002944	GC	3	6	3034541	3034546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_002944	GAA	2	6	3034547	3034552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_002944	CGC	3	9	3035428	3035436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_002944	GTG	2	6	3035444	3035449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_002944	GCA	2	6	3036792	3036797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_002944	CGGGCG	2	12	3036846	3036857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_002944	GCCG	2	8	3037825	3037832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_002944	CTC	2	6	3038270	3038275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_002944	GCC	2	6	3038311	3038316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_002944	CTG	2	6	3038351	3038356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_002944	GCG	2	6	3039926	3039931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_002944	GCG	2	6	3040743	3040748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_002944	CGT	2	6	3040777	3040782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_002944	CGC	2	6	3040792	3040797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_002944	AGC	2	6	3040845	3040850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_002944	GCCG	2	8	3040852	3040859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_002944	ACC	2	6	3040885	3040890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_002944	CGG	2	6	3046745	3046750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_002944	CGA	2	6	3053174	3053179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_002944	GGGT	2	8	3056232	3056239	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_002944	CGG	2	6	3056889	3056894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_002944	CG	3	6	3056904	3056909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_002944	CGC	2	6	3058363	3058368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_002944	GAC	2	6	3058417	3058422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_002944	CGC	2	6	3058423	3058428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_002944	CTC	2	6	3060903	3060908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_002944	CAAT	2	8	3061286	3061293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_002944	GCG	2	6	3062246	3062251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_002944	GCG	3	9	3062404	3062412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_002944	ACG	2	6	3062433	3062438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_002944	CAT	2	6	3062467	3062472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_002944	TCG	2	6	3062519	3062524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_002944	A	6	6	3062568	3062573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_002944	AAC	2	6	3062594	3062599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_002944	AC	3	6	3062615	3062620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_002944	GGGGA	2	10	3062681	3062690	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_002944	GGCG	2	8	3065554	3065561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_002944	GGCA	2	8	3067057	3067064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6088	NC_002944	ATC	2	6	3067072	3067077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_002944	CCGAA	2	10	3067081	3067090	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6090	NC_002944	CGCGC	2	10	3067105	3067114	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6091	NC_002944	AAC	2	6	3067140	3067145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_002944	GCG	2	6	3067153	3067158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_002944	CGG	2	6	3067319	3067324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_002944	CCG	2	6	3069179	3069184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_002944	CAT	2	6	3069192	3069197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6097	NC_002944	GCC	2	6	3069349	3069354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_002944	TGG	2	6	3069356	3069361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_002944	GCT	2	6	3069378	3069383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6101	NC_002944	GGA	2	6	3069396	3069401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_002944	AGAC	2	8	3073904	3073911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_002944	GTCT	2	8	3073953	3073960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_002944	CAGA	2	8	3073962	3073969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_002944	TGC	2	6	3074484	3074489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_002944	CTG	2	6	3077163	3077168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_002944	ACCAG	2	10	3077193	3077202	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6109	NC_002944	CGGGC	2	10	3077241	3077250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6110	NC_002944	CGAG	2	8	3077283	3077290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_002944	AAC	2	6	3077296	3077301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_002944	TCGAC	2	10	3077309	3077318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6113	NC_002944	CGG	2	6	3077341	3077346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_002944	CGG	2	6	3077348	3077353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_002944	CCG	2	6	3077361	3077366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_002944	CGC	2	6	3077371	3077376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_002944	CGGC	2	8	3077903	3077910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_002944	GCC	2	6	3077921	3077926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_002944	CGGGCC	2	12	3077931	3077942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_002944	GAA	2	6	3077954	3077959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_002944	CGC	2	6	3080421	3080426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_002944	CGG	2	6	3080457	3080462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_002944	TGG	2	6	3081223	3081228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_002944	GGT	2	6	3081288	3081293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_002944	ACG	2	6	3081367	3081372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_002944	CGA	2	6	3081397	3081402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_002944	GAC	2	6	3081427	3081432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_002944	CGA	2	6	3081512	3081517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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